В соответствии с решением президиума Совета при Президенте Российской Федерации по противодействию коррупции  от 16 февраля 2011 г. (протокол заседания № 22) и постановлением Правительства Российской Федерации от 31.01.2012 г. № 50 на Институт возложены функции Междисциплинарного центра по координации научного и учебно-методического обеспечения противодействия коррупции.

Институт является непосредственным исполнителем мероприятий Национальных планов противодействия коррупции, утвержденных Указами Президента Российской Федерации от 11.04.2014 г. № 226 (пп. «е» пункта 2), от 1 апреля 2016 г. № 147 (пп. «з» пункта 1);  от 29 июня 2018 г. № 378 (пп. «а», «б» пункта 31, пп. «б» пункта 39), в части проведения междисциплинарных научных исследований законодательства о противодействии коррупции и практики его применения, а также проведения ежегодного Евразийского антикоррупционного форума.

В соответствии с возложенными на Институт функциями в области научно-методического обеспечения противодействия коррупции научно-экспертная деятельность отдела осуществляется в следующих направлениях:

• фундаментальные исследования в области противодействия коррупции и смежных с ней областях;
• тенденции развития законодательства о противодействии коррупции;
• антикоррупционная экспертиза нормативных правовых актов и проектов нормативных правовых актов;
• конфликт интересов на государственной и муниципальной службе;
• роль институтов в противодействии коррупции;
• защита лиц, сообщающих о фактах коррупции;
• социально-правовая природа коррупции и антикоррупционных механизмов;
• анализ иностранных антикоррупционных практик;
• правовое регулирование противодействия коррупции в субъектах Российской Федерации и в муниципальных образованиях;
• научно-методическое обеспечение противодействия коррупции;
• подготовка учебных программ, формирование учебно-методических комплексов по вопросам противодействия коррупции.
• ответственность за коррупционные правонарушения;
• организация научных мероприятий, посвященных вопросам противодействия коррупции.

Отдел обеспечивает деятельность Междисциплинарного Совета по координации научного и учебно-методического обеспечения противодействия коррупции.

В рамках своей работы отдел методологии противодействия коррупции осуществляет активное международное научное сотрудничество с Международной антикоррупционной академией (IACA, Австрия, г. Лаксенбург) и ведущими зарубежными научными центрами (Университетом Парижа 1 Пантеон-Сорбонна, Институтом права Китайской академии общественных наук, Пудунской академией подготовки руководящих кадров ЦК КПК (СЕLAP), Белорусским государственным университетом, Институтом законодательства и правовой информации Республики Казахстан»).

Ведущие научные сотрудники отдела входят в составы комиссий по соблюдению требований к служебному поведению и урегулированию конфликта интересов, а также аттестационных комиссий федеральных органов исполнительной власти.

Работники отдела осуществляют выездные эмпирические исследования, анализируют правореализационную практику органов власти субъектов Российской Федерации и муниципальных образований, государственных корпораций и компаний.