В связи с рассмотрением в Венецианской комиссии проекта заключения по Федеральному закону от 20.07.2012 года № 121-ФЗ «О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации в части регулирования деятельности некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента» и Федеральному закону от 12 ноября 2012 г. № 190-ФЗ «О внесении изменений в Уголовный кодекс Российской Федерации и в статью 151 Уголовно-процессуального кодекса Российской Федерации» в работе пленарной сессии Комиссии приняла участие расширенная делегация Российской Федерации. В ее состав вошли заместитель представителя Российской Федерации в Венецианской комиссии В.И. Лафитский (руководитель делегации); заместитель Председателя Комитета по конституционному законодательству и государственному строительству ГД РФ Д.Ф. Вяткин; начальник управления по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности, межнациональных отношениях, противодействии экстремизму и терроризму Генпрокуратуры РФ Ю.П. Хохлов; руководитель департамента по работе с НКО Министерства юстиции РФ Т.В. Вагина; начальник отдела по связям с субъектами федерации, парламентом и общественными объединениями МИД РФ С.А. Попов; руководитель секретариата делегации РФ в Венецианской комиссии Р.А. Курбанов.

Консолидированная позиция представителей Российской Федерации по проекту заключения Венецианской комиссии была представлена 12 июня 2014 года В.И. Лафитским на совещании рабочей группы по подготовке проекта заключения, а также на заседании подкомиссии по основным правам. Представитель Российской Федерации указывал на недопустимость произвольного объединения  в одном заключении двух федеральных законов, поскольку они регулируют разные вопросы и не имеют точек соприкосновения по применяемым правовым механизмам и подпадающим под их действие лицам. Такой формат подачи материала, создающий общий негативный фон в качестве ключевой предпосылки анализа, не соответствует и запросу Парламентской ассамблеи Совета Европы о подготовке отдельных заключений по указанным федеральным законам. Представителем Российской Федерации подчеркивалась необходимость расширения международно-правового анализа федеральных законов, в том числе за счет международно-правовых норм, закрепляющих принцип невмешательства во внутренние дела государств; отмечалась целесообразность более полного сравнительно-правового анализа ограничений деятельности НКО и ответственности за государственную измену и шпионаж; выдвигались предложения по устранению допущенных неточностей и некорректных суждений в оценках  российского законодательства; были представлены статистические данные, иллюстрирующие практику применения указанных федеральных законов.

По итогам обсуждений рабочей группой по подготовке проекта заключения были представлены поправки, устранившие ряд неточностей и смягчившие общую тональность  оценок. Была скорректирована и консолидированная позиция представителей Российской Федерации. Текст этого документа был роздан 13 июня 2014 г. всем членам Венецианской комиссии перед обсуждением проекта заключения на пленарном заседании Комиссии. 

На пленарном заседании позицию представителей Российской Федерации представил заместитель Председателя Комитета по конституционному законодательству и государственному строительству ГД РФ Д.Ф. Вяткин. Он отметил политизированный характер проекта заключения, что не соответствует задачам, стоящим перед Венецианской комиссией. Было вновь обращено внимание на недопустимость объединения в одном заключении двух федеральных законов; подчеркнуто требование учитывать суверенитет и международно-правовые нормы невмешательства во внутренние дела государств; указано на то обстоятельство, что негативные оценки федеральных законов не подтверждаются практикой их применения (в частности, были приведены данные, что за 2012 – 2013 гг. в Российской Федерации за государственную измену и шпионаж было осуждено только 7 человек и что ни одно лицо не было привлечено к уголовной ответственности за неисполнение законодательства о регулировании деятельности некоммерческих организаций, выполняющих функции иностранного агента). Вместе с тем, выступавший признал правомерность замечаний о необходимости соблюдения пропорциональности установленных санкций  тяжести правонарушений. В заключение  Д.Ф. Вяткин предложил доработать проект заключения и перенести его принятие на следующую пленарную сессию Венецианской комиссии. 

Однако это предложение было отклонено. Проект заключения был поставлен на голосование с поручением авторам проекта доработать его с учетом замечаний представителей Российской Федерации и  последних поправок, внесенных в федеральное законодательство, регулирующее деятельность некоммерческих организаций. Проект заключения был принят большинством голосов. Против проголосовал заместитель представителя Российской Федерации в Венецианской комиссии В.И. Лафитский, указавший на недопустимость произвольного объединения в одном заключении анализа двух федеральных законов и одобрения того документа, который еще не существует. 

На пленарной сессии Венецианской комиссии в соответствии с утвержденной повесткой были приняты заключения по законопроектам и действующим законодательным актам Албании, Армении, Азербайджана, Грузии, Кыргызстана, Словакии, Таджикистана; одобрены совместный доклад Венецианской комиссии и Института Макса Планка о свободе собраний, а также пересмотренное руководство Венецианской комиссии и ОБСЕ/БДИПЧ по критериям правового статуса религиозных объединений; заслушана информация о конституционных изменениях в Норвегии, Тунисе, Турции, Армении, обсуждены организационные вопросы проведения юбилейной (сотой) пленарной сессии Венецианской комиссии, другие вопросы повестки дня.